Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Trim39-205ENSMUST00000173369 2914 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm44986-201ENSMUST00000206292 2829 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Pou2f1-201ENSMUST00000027850 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lpar1-202ENSMUST00000107570 3244 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm17184-202ENSMUST00000227180 1586 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm10683-201ENSMUST00000211556 1374 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm12046-201ENSMUST00000118536 331 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21783-201ENSMUST00000179570 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21785-201ENSMUST00000185440 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29075-201ENSMUST00000185717 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm20889-201ENSMUST00000185749 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21741-201ENSMUST00000185883 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm20927-201ENSMUST00000186168 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21810-201ENSMUST00000186188 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm28611-201ENSMUST00000186429 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21832-201ENSMUST00000186439 691 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21308-201ENSMUST00000186571 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21271-201ENSMUST00000186689 693 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21282-201ENSMUST00000186766 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21462-201ENSMUST00000186803 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21753-201ENSMUST00000187240 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21864-201ENSMUST00000187269 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm28603-201ENSMUST00000187297 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21879-201ENSMUST00000187583 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21751-201ENSMUST00000188043 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29317-201ENSMUST00000188216 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21724-201ENSMUST00000188264 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21782-201ENSMUST00000188517 678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21881-201ENSMUST00000188591 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm20863-201ENSMUST00000188992 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm28093-201ENSMUST00000189016 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21779-201ENSMUST00000189508 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21745-201ENSMUST00000189513 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21869-201ENSMUST00000189976 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21918-201ENSMUST00000190310 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm29279-201ENSMUST00000190324 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Riok3Q9DBU3 Gm21805-201ENSMUST00000190371 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms