Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Ccdc47Q9D024 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Ccdc47Q9D024 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Ccdc47Q9D024 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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Ccdc47Q9D024 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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Ccdc47Q9D024 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
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Ccdc47Q9D024 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc47Q9D024 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
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