Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Grm8-201ENSMUST00000090512 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Prom1-214ENSMUST00000197706 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Mrpl15-206ENSMUST00000156816 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Ccnd2-201ENSMUST00000000188 6330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprtQ99M80 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms