Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms