Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NischQ80TM9 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms