Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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Dsg1bQ7TSF1 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Dsg1bQ7TSF1 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms