Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Phyhd1-203ENSMUST00000113643 1195 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm46995-201ENSMUST00000223445 1378 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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