Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm10046-202ENSMUST00000208942 126 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm15738-205ENSMUST00000210378 1051 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC140477.2-201ENSMUST00000222037 322 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 CU074400.1-201ENSMUST00000224411 220 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC165265.1-201ENSMUST00000225929 439 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 CT025533.1-201ENSMUST00000227485 706 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Xcl1-201ENSMUST00000027860 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Krtap10-4-201ENSMUST00000092369 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm10272-201ENSMUST00000092371 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Taok3-201ENSMUST00000092889 4354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Sub1-201ENSMUST00000022816 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC160118.1-201ENSMUST00000214497 2457 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Stmnd1-201ENSMUST00000076622 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Etos1-201ENSMUST00000057134 2015 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm10696-202ENSMUST00000167916 2205 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 C230053D17Rik-201ENSMUST00000214451 2246 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 4732419C18Rik-201ENSMUST00000181805 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Dpy19l4-201ENSMUST00000084892 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm4279-201ENSMUST00000154314 2329 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Cxcl2-202ENSMUST00000200681 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Crxos-204ENSMUST00000150050 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Zmym1-203ENSMUST00000106102 3852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 1700034J05Rik-201ENSMUST00000036592 3007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm26628-201ENSMUST00000181028 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Aldh7a1-208ENSMUST00000174518 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Acsl6-206ENSMUST00000101211 3106 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Mir681-201ENSMUST00000102111 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm22546-201ENSMUST00000104351 130 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Zscan30-201ENSMUST00000115829 484 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm6964-201ENSMUST00000117206 437 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm14470-201ENSMUST00000119085 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm8682-201ENSMUST00000121310 498 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm12542-201ENSMUST00000133015 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 1700120E14Rik-201ENSMUST00000137034 732 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm23827-201ENSMUST00000157116 145 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm22484-201ENSMUST00000157992 306 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm6822-201ENSMUST00000161440 307 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm9844-201ENSMUST00000170837 485 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm25306-201ENSMUST00000175288 117 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm7545-201ENSMUST00000182773 1008 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms