Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms