Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 CT009530.1-201ENSMUST00000227348 2927 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm12970-201ENSMUST00000134911 581 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm44317-201ENSMUST00000204314 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TrioQ0KL02 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms