Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms