Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Nlrp14-202ENSMUST00000142623 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm23985-201ENSMUST00000157140 124 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm5459-201ENSMUST00000171235 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Ly6g6c-203ENSMUST00000174876 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Olfr925-ps1-201ENSMUST00000217295 780 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 D330037F02Rik-202ENSMUST00000217400 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Rpl19-ps2-201ENSMUST00000219540 590 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm46344-201ENSMUST00000220530 887 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Ctsw-201ENSMUST00000025844 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Sell-202ENSMUST00000097491 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Egf-209ENSMUST00000199615 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gem-201ENSMUST00000029868 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm33111-202ENSMUST00000219954 3388 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Xlr4c-203ENSMUST00000114530 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm8711-201ENSMUST00000163114 883 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm20717-201ENSMUST00000176762 657 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm4307-201ENSMUST00000177945 910 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm8266-201ENSMUST00000179745 1192 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm29572-201ENSMUST00000190305 283 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm18840-201ENSMUST00000204553 506 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm4303-201ENSMUST00000218922 910 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm4305-201ENSMUST00000219159 910 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC117608.1-202ENSMUST00000224074 1049 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 AC140244.1-201ENSMUST00000228454 229 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Olfr523-201ENSMUST00000055890 1056 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Zwint-201ENSMUST00000020081 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChgaP26339 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms