Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm26942-201ENSMUST00000182854 797 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Lcn2-201ENSMUST00000050785 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm44986-201ENSMUST00000206292 2829 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ano4-208ENSMUST00000182613 3880 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm12834-201ENSMUST00000121855 2829 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 2610001J05Rik-204ENSMUST00000185361 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm37065-203ENSMUST00000192498 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm28307-201ENSMUST00000190685 2694 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Stxbp5l-205ENSMUST00000114782 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sptan1P16546 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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