Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc180J3QNE4 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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