Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms