Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Prdm2A2A7B5 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prdm2A2A7B5 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms