Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm5538W4VSP6 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms