Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Txndc16-204ENSMUST00000128484 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rnf4Q9QZS2 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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