Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15833-201ENSMUST00000161563 957 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm5256-201ENSMUST00000191412 877 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm4873-201ENSMUST00000199402 1203 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45346-201ENSMUST00000209925 1273 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC124577.1-201ENSMUST00000214044 487 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC134254.3-201ENSMUST00000223533 575 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15328-204ENSMUST00000210330 1518 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Hdhd2-207ENSMUST00000147332 1705 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr45-201ENSMUST00000084454 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr1239-201ENSMUST00000099780 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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