Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Hecw1Q8K4P8 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Hecw1Q8K4P8 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hecw1Q8K4P8 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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