Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rfx6Q8C7R7 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms