Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NischQ80TM9 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms