Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Klhl10-201ENSMUST00000001599 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm4450-201ENSMUST00000167753 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 9230102K24Rik-201ENSMUST00000219459 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Mlst8-201ENSMUST00000070888 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Ccdc33-203ENSMUST00000098682 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Erc2-210ENSMUST00000211145 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Ttc16-207ENSMUST00000161950 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Wfdc11-202ENSMUST00000167694 249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr326-ps1-201ENSMUST00000204790 392 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm5737-201ENSMUST00000208668 1272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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