Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Ttc39dQ0VF76 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms