Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cux1P53564 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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