Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm3822-201ENSMUST00000201941 2935 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Stk36-202ENSMUST00000087186 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Chd1P40201 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chd1P40201 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms