Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PtprkP35822 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprkP35822 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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