Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Slc12a8-201ENSMUST00000059056 3166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Zfp607a-201ENSMUST00000053722 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Hoxd8P23463 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms