Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Pou4f1P17208 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Pou4f1P17208 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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Pou4f1P17208 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Pou4f1P17208 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pou4f1P17208 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pou4f1P17208 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 322 ms