Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr555-201ENSMUST00000098220 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1303-201ENSMUST00000099609 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm38051-201ENSMUST00000193740 433 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb2P13373 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms