Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm13944-202ENSMUST00000146495 542 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps41-201ENSMUST00000173587 980 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr444-201ENSMUST00000095955 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms