Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 5430427N15Rik-201ENSMUST00000200007 2393 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 G730013B05Rik-201ENSMUST00000180509 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Utrn-204ENSMUST00000217994 3161 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Frk-202ENSMUST00000170771 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Usp9yF8VPU6 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Usp9yF8VPU6 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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Usp9yF8VPU6 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Usp9yF8VPU6 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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