Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
H2-M1F7CXU4 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-M1F7CXU4 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms