Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Prrt4B2RU40 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms