Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms