Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 1190005I06Rik-203ENSMUST00000180677 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Mir7659-201ENSMUST00000184079 58 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm12121-201ENSMUST00000131630 500 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm8877-201ENSMUST00000172657 655 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr1392-201ENSMUST00000189851 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms