Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Naalad2-204ENSMUST00000166825 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm12917-201ENSMUST00000119850 639 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13360-201ENSMUST00000121607 799 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm23195-201ENSMUST00000158814 129 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Mrgprc7-ps-201ENSMUST00000187169 952 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 5830408C22Rik-204ENSMUST00000211653 351 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 AC192334.3-201ENSMUST00000221828 569 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC156576.1-201ENSMUST00000222315 500 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Ccser2-209ENSMUST00000183038 1681 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC100590.1-201ENSMUST00000220318 1357 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Clca2-201ENSMUST00000040465 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Magi2-215ENSMUST00000208219 3266 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14762-202ENSMUST00000122953 1430 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
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