Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Ccdc47Q9D024 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms