Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC122829.1-201ENSMUST00000219743 1631 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm10390-201ENSMUST00000180812 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4930500F10Rik-201ENSMUST00000180701 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Trim35Q8C006 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Trim35Q8C006 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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