Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp47Q8BY87 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms