Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp54Q8BL06 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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