Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rph3alQ768S4 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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