Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms