Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms