Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms