Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Ccndbp1Q3TVC7 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Ccndbp1Q3TVC7 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Ccndbp1Q3TVC7 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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