Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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