Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ttc21bQ0HA38 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms