Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 L3mbtl3-202ENSMUST00000105519 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm14204-202ENSMUST00000123944 5380 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms