Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CopeO89079 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CopeO89079 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CopeO89079 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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CopeO89079 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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CopeO89079 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CopeO89079 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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